Pompy ciepła mogą mieć problemy z niskim przepływem powietrza, nieszczelnymi kanałami i nieprawidłowym napełnieniem czynnikiem chłodniczym. Na każdą tonę wydajności klimatyzacji pompy ciepła powinien przypadać około 400 do 500 stóp sześciennych na minutę (cfm). Wydajność i wydajność pogarszają się, jeśli przepływ powietrza jest znacznie mniejszy niż 350 cfm na tonę. Technicy mogą zwiększyć przepływ powietrza, czyszcząc wężownicę parownika lub zwiększając prędkość wentylatora, ale często konieczne są pewne modyfikacje kanałów. Zobacz minimalizowanie strat energii w kanałach i kanałach izolacyjnych.

Systemy chłodnicze powinny być sprawdzane pod kątem szczelności podczas instalacji i podczas każdego zgłoszenia serwisowego. Opakowane pompy ciepła są fabrycznie napełnione czynnikiem chłodniczym i rzadko są nieprawidłowo naładowane. Z drugiej strony pompy ciepła z systemem Split są ładowane w terenie, co czasami może skutkować zbyt dużą lub zbyt małą ilością czynnika chłodniczego. Pompy ciepła z systemem dzielonym, które mają prawidłowe napełnienie czynnikiem chłodniczym i przepływ powietrza, zwykle działają bardzo zbliżone do podanych przez producenta SEER i HSPF. Jednak za dużo lub za mało czynnika chłodniczego zmniejsza wydajność i sprawność pompy ciepła.